在卡尔别达尔失踪之后，小智的生活进入了一种紧张而期待的状态。

　　这个世界里的警察系统非常不给力，失踪的帅气男子到现在都找不到，这让小智一直很担心。

　　这家伙难道被控制了，准备做些什么阴谋吗？

　　小智去救的这个极巨化事件影响也开始不断发酵。首先是让宝可梦联盟的声誉在阿罗拉地区一落千丈。

　　管理长露珊妮与枯骨队勾结胡作非为的事情被国际刑警公开，分部长兼技术团队首领法巴擅自开启极巨化的破坏行为也被国际刑警质问，允许宝可梦联盟一直保持正面形象的最大程度受到了污名化。

　　作为副分部长的碧卡不得不站出来处理社会关系危机，声称管理长露珊妮已经主动认错辞职，法巴职位也直接降为普通职员，从此只负责科学研究工作，勉强平息了风波。

　　不过，碧卡原本也不打算再让露珊妮参与宝可梦联盟的运作。从极巨之海出来后，露珊妮的身体极其虚弱，不仅全身无力，还因为受到尼希勒戈神经毒素的腐蚀，精神状态极差，根本无法承担宝可梦联盟的工作。

　　再说，如果不是因为在穿越时已经开始与尼希勒戈融合，有尼希勒戈保护着她的意识，现在说不定她已经失去记忆了。

　　本来碧卡是想让格拉吉欧担任管理长的，结果……这家伙在国际刑警那里有前科，和枯骨队勾结在一起！

　　这个身份相当敏感。

　　但格拉吉欧此时二少爷根本看不起做什么管理长，在见识到小智几乎摧毁半个空间力量之后，他收起了傲慢的性格，决定一步步地挑战诸岛巡礼。

　　母亲受伤静养，哥哥再次离家出走……所以现在只能由莉莉担任宝可梦联盟的代理管理长。

　　莉莉无奈地担任了管理长，但格拉吉欧也与碧卡达成了协议：名义上是管理长，但实际上不管事。

　　相当于现在这么大的宝可梦联盟实际上是由碧卡一个人在处理，每天忙得不可开交。

　　小智这段时间一直在等待关东的消息，达尔兹把自己传送到水晶高原，与弗拉加利特和彩虹大学的希德博士特别龙实验室联合进行某种战斗开发工作，极巨能量遮蔽装置也被安装在最新的战斗服上。

　　小智为了保护自己的学生，从强大的实力者手中守护他们，普通的极巨怪兽不会造成麻烦，但这些学生的实力还不算成熟，需要一些帮助。

　　小智看中了洛托斯基对E战斗服的研究。

　　将E战斗服与极巨能量遮蔽装置结合，制造全新的战斗服来保护学生们的安全。

　　同时，学校下面也在悄悄地进行工程改造，这是碧卡拜托小智做的。

　　为了挽回宝可梦联盟的形象，碧卡主动请缨处理无意间闯入阿罗拉地区的极巨怪兽事件，选定了小智的学生们作为候选人，会在配备各种装备和补给品后对抗迷路的极巨怪兽。

　　当然，即将整合的极巨防御队最多只能算是一个分散的“好市民”组织，一旦有大规模入侵，还是要依靠小智和这个世界的高级力量来进行抵抗。

　　除了这些琐碎的事情外，小智每天要做的事情就是帮助莉莉治疗露珊妮的伤势。

　　身体上的伤可以靠上帝之手治愈，精神上的创伤可以依靠魂精灵和克蕾西娅来缓解，小智并不急于求成，在确保安全的情况下，让露珊妮的身体逐渐好转。

　　“好了，从明天开始不需要继续治疗，只需要再休养一段时间就可以完全恢复。”今天治疗结束后，小智告诉莉莉这个好消息。

　　露珊妮终于痊愈了。

　　“小智老师，我真的不知道该怎样感谢您。”莉莉一路送小智到别墅门口，对小智这几天所做的一切都非常感激。

　　“莉莉，如果我的母亲遇到这样的情况，其实也是因为我，你相信吗？”小智在树下停了下来，树叶的阴影打在他脸上，让莉莉看不清他的表情。

　　“小智老师……您在说什么？母亲的遭遇……明明是我们给你们添了很多麻烦，为什么……”莉莉不解地问道，“之前也是如此，您在天伦祭坛的时候也说过很奇怪的话。我有什么错……”

　　“因为真的是我错了。”小智有些勉强地笑了笑，“事实上，我早就知道你的母亲在谋夺极巨怪兽的力量，也知道她觊觎云朵小屋很久了。我……在我消灭枯骨队的时候曾经利用你威胁过你哥哥，格拉吉欧把你们小时候发生的事情全都告诉我了。从那时起我就知道，要想让你恢复记忆，就必须带你回到你小时候被尼希勒戈袭击的地方。可以说，后来我借给你云朵小屋，让你恢复记忆，让你母亲利用云朵小屋来到极巨之海后发生的所有事情，都是我的计划……”

　　“为……为什么？小智老师，您为什么要这么做！我不明白，我真的不明白……”莉莉痛苦地摇了摇头，“您为什么要设计这样的计划，让母亲陷入险境？”

　　“对不起……”小智轻声说道，“我需要获取宝可梦联盟与极巨怪兽相关的所有研究资料。而且，我不能让露珊妮在宝可梦联盟掌权时的样子留在碧卡手中，所以我做了这一切。我必须与极巨怪兽对抗，但在国际刑警进入阿罗拉地区，当莉拉开始讨论你母亲的时候，我们的进展非常不顺利。你母亲也不想与我们合作，反而固执地想要开启极巨化，甚至不愿对我们坦诚……我最终只能决定这个计划。老实说，包括消灭枯骨队、找到她和古茨马的往来证据，以及趁机公布，也是我的计划的一部分。”

　　“……是这样吗？”莉莉沉默了很久，最后缓缓开口，语气中没有喜怒，只有彻底的平静。

　　“小智老师，事情已经到了这个地步，您为什么还要把这些告诉我？”